Задача: Собрать из разных файлов определенные столбцы в один большой набор данных
Проблема: Записываются данные только из одного файла
Проблема: Записываются данные только из одного файла
Python:
import os
import pandas as pd
import csv
import pathlib
path = "D"
dirs = os.listdir(path)
def collect_data(dirs):
df_main = pd.DataFrame()
for file in dirs:
# print (file)
dir_path = os.path.abspath(file)
df1 = pd.read_csv(str(dir_path), sep = "\t")
df_1 = pd.DataFrame( df1[["RPKM_M"]])
# file += file
dir_path_tmp = os.path.abspath(file)
df2 = pd.read_csv(str(dir_path_tmp), sep = "\t")
df_2 = pd.DataFrame(df2[["RPKM_M"]])
df_main = pd.concat([df_1, df_2], axis=1)
return df_main
collect_data(dirs).to_csv('main.csv')